Alineamiento de secuencias de proteína y filogenias

Abstract

Este curso es un tutorial paso a paso sobre cómo definir una familia de proteínas y caracterizar su estructura secundaria y terciaria, incluyendo posibles regiones desordenadas, por medio de alineamientos que podremos aprovechar para inferir una filogenia molecular. A lo largo del texto hay referencias a la literatura especializada y algunos enlaces a recursos externos recomendados.

El texto está en español, aunque encontrarás enlaces y figuras en inglés. Para completar el estudio de estos temas recomendamos estos recursos:

* Algoritmos en bioinformática estructural <http://eead-csic-compbio.github.io/bioinformatica_estructural> * Bioinformática con Ñ <https://zenodo.org/communities/bioinfconn> * The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing <http://www.cambridge.org/us/academic/subjects/life-sciences/genomics-bioinformatics-and-systems-biology/phylogenetic-handbook-practical-approach-phylogenetic-analysis-and-hypothesis-testing-2nd-edition>

y el blog de nuestro laboratorio, donde de vez en cuando tocamos temas relacionados:

* #!/perl/bioinfo <http://bioinfoperl.blogspot.com.es>

Puedes descargar este material en formato PDF en Digital.CSIC <http://digital.csic.es/handle/10261/117608> (bajo Licencia Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International -CC BY-NC-ND 4.0-).

Este material fue creado inicialmente en 2015 para el curso de verano "Estructura y Función de Proteínas" <http://bioinfoperl.blogspot.com.es/2015/04/curso-de-verano-estructura-y-funcion-de.html> de la Universidad de Zaragoza. En 2018 lo hemos actualizado, agregando un apartado específico para la predicción de regiones desordenadas, con motivo del curso "Nuevos Retos en Biología Molecular: las proteínas dúctiles y sus aplicaciones" <https://bioinfoperl.blogspot.com/2018/04/curso-proteinas-ductiles-aplicaciones.html>.