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Invitar a revisión por pares abierta
Título

Diversidad de microorganismos aerobios y cultivables en ambientes hipersalinos mediante el uso de MALDI-TOF/MS y filogenia basada en RNAr 16S

AutorViver, Tomeu CSIC ORCID; Cifuentes, Ana CSIC; Rosselló-Mora, Ramón CSIC ORCID
Fecha de publicación10-may-2013
CitaciónXI Reunión de la Red Nacional de Microorganismos Extremófilos (2013)
ResumenEl trabajo que se presenta consistió en el estudio y comparación de la diversidad de microorganismos halófilos cultivables de las salinas solares de la Trinidad (Delta del Ebro) y de Boyeruca (Chile) obtenidos a partir de salmueras y sedimentos. En total se obtuvieron 707 aislados de las salinas de la Trinidad y 731 de Boyeruca a partir de siembra directa sobre medio SW al 20% y 30% p/v de sales. Todos los aislados se analizaron mediante la técnica de MALDI-TOF/MS (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization – Time of Flight MassSpectrometry) utilizando biomasa celular intacta. Del total de muestras analizadas se seleccionaron 572 perfiles válidos procedentes de la colección de microorganismos de las salinas de la Trinidad y 677 de la de Boyeruca. Se compararon los perfiles espectrométricos de los aislados con el software BioTyper (Bruker Daltonics). Estos perfiles se emplearon para construir dendrogramas basados en porcentajes de similitud. De los grupos generados en el dendrograma se eligieron varios representantes para llevar a cabo su identificación por secuenciación del gen codificante del ARNr 16S. Mediante la reconstrucción filogenética de las secuencias se comprobó que la mayoría de aislados del dominio Bacteria recuperados de las salinas de la Trinidad se correspondían con Salinibacter ruber. Por otra parte, los aislados del dominio Archaea se correspondieron con Halorubrum, Haloarcula, Halobellus, Halovibrio, Natronomonas, Halomicrobium y Halorhabdus. De las muestras de Boyeruca no se ha conseguido aislar ningún miembro del dominio Bacteria. Todos los aislados de estas muestras se afiliaron a la familia Halobacteriaceae (géneros Halosarcina, Haloarcula, Halorubrum, Haloterrigena, Halolamina, Haloferax, Halobacterium y Natronoarchaeum). Tanto en las salinas de la Trinidad como Boyeruca, los géneros más recuperados para el dominio Archaea fueron Halorubrum y Haloarcula. Además, se observó que en ambas localizaciones la diversidad de Archaea en sedimentos es mayor que en salmueras
DescripciónComunicación presentada en la XI Reunión de la Red Nacional de Microorganismos Extremófilos, celebrada del 8 al 10 de mayo de 2013 en Busquistar, Granada (España)
URIhttp://hdl.handle.net/10261/123706
Aparece en las colecciones: (IMEDEA) Comunicaciones congresos




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