Calculation of Structural Behavior of Indirect NMR Spin-Spin Couplings in the Backbone of Nucleic Acids

0043157 - ÚOCHB 2007 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sychrovský, Vladimír - Vokáčová, Zuzana - Šponer, Jiří - Špačková, Naďa - Schneider, Bohdan
Calculation of Structural Behavior of Indirect NMR Spin-Spin Couplings in the Backbone of Nucleic Acids.
[Výpočty strukturního chování spin-spinových štěpících konstant mezi atomy páteře nukleových kyselin.]
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 110, č. 45 (2006), s. 22894-22902. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA MŠMT(CZ) LC512
Grant ostatní: NSF(US) DBI 0110076
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50040507
Klíčová slova: nucleic acids * RNA * DNA * molecular structure
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.115, rok: 2006

Values of indirect NMR spin-spin coupling constants between 31P, 13C, and 1H nuclei calculated by high-level quantum mechanics were related to the backbone torsion angles of nucleic acids. It was shown that the coupling constants can facilitate accurate and reliable structural interpretation of NMR measurements and help to discriminate between distinct conformational classes of nucleic acids.

Vypočtené NMR spin-spinové štěpící konstanty mezi jádry 31P, 13C a 1H byly korelovány s torzními úhly pro atomy podél páteře nukleových kyselin. Bylo ukázáno, že štěpící konstanty lze použít k přesné a spolehlivé interpretaci NMR experimentů a s jejich pomocí lze rozlišit různé konformační třídy nukleových kyselin.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0003678