Statistical correlations of primer thermodynamic stability delta G0 for enhanced flax ISSR-PCR cultivar authentication

0102843 - UMBR-M 20043059 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wiesner, Ivo - Wiesnerová, Dana
Statistical correlations of primer thermodynamic stability delta G0 for enhanced flax ISSR-PCR cultivar authentication.
[Statistické korelace termodynamické stability PCR primerů G0 pro kvalitnější identifikaci kultivarů lnu užitím ISSR-PCR metody.]
Journal of Agricultural and Food Chemistry. Roč. 52, - (2004), s. 2568-2571. ISSN 0021-8561. E-ISSN 1520-5118
Grant CEP: GA ČR GA521/03/0019
Klíčová slova: flax * genetic markers
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.327, rok: 2004

We revealed four statistically significant correlations related to inter-simple-sequence repeat :ISSR patterns: 1 between free energy G0 of ISSR primer and the reamplification intensity :dAi, 2 between free energy G0 of ISSR primer and PIC coefficient, 3 resp. 4 between free energy G0 of anchor sequence of primer and the number of total, resp. polymorphic bands in ISSR patterns. Methodological recommendations for effective ISSR primer design were inferred based on revealed correlations.

Nalezli jsme čtyři statisticky významné korelace vztahující se ke gelovým spektrům ISSR-PCR: 1 mezi volnou energií G0 ISSR primeru a intenzitou reamplifikace PCR: dAi, 2 mezi volnou energií G0 ISSR primeru a PIC koeficientem, 3 resp. 4 mezi volnou energií G0 sekvenční kotvy primeru a počtem veškerých, resp. polymorfních pruhů v ISSR spektrech. Z těchto korelací byla vyvozena metodická doporučení pro efektivnější navrhování ISSR primerů.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0010180