Oligonucleotide-based microarray detection of plant viruses

0027739 - UMBR-M 2006 SIGLE PL eng A - Abstrakt
Šíp, M. - Bystřická, Dagmar - Lenz, Ondřej - Mráz, Ivan - Piherová, L. - Kmoch, S.
Oligonucleotide-based microarray detection of plant viruses.
[Detekce rostlinných virů pomocí oligonukleotidových mikročipů.]
Meeting COST 853 Agricultural Biomarkers for Array-Technology: WG1 Nucleic acid microarrays, WG2 Protein microarrays. Gdansk: Faculty of Biotechnology University of Gdansk, 2005. s. 12.
[Meeting COST 853 Agricultural Biomarkers for Array-Technology: WG1 Nucleic acid microarrays, WG2 Protein microarrays. 19.06.2005-21.06.2005, Gdansk]
Grant CEP: GA ČR GA522/01/1105; GA MŠMT OC 853.002
Klíčová slova: biomarkers * microarrays
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie

The DNA-microarray technology for the purpose of detection of plant viruses has been mostly based on glass hybridisation arrays containing relatively long anchored DNA fragments as probes. In this work the method was successfully used for exampe for identification of potato vituses PVY, PVA, PVX and PVS in single infection by Boonhamet (2003) and for detection and determination of the cucurbit-infecting Tobamovirus by Lee (2003).

Použití technologie mikročipů představuje relativně novou metodiku v diagnostice rostlinných patogenů. Současné metody umožňují přípravu téměř libovolných prób pro detekci příslušné nukleové kyseliny. V této práci byly navrženy krátké jednořetězcové DNA próby pro detekci hlavních virových patogenů bramboru v ČR. Schopnost takto připraveného mikročipu detekovat a odlišit od sebe příslušné viry nebo jejich kmeny byla prokázána.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0117794