Počet záznamů: 1
Cations and hydration in catalytic RNA: Molecular dynamics of the hepatitis delta virus ribozyme
- 1.0040367 - BFÚ 2007 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Krasovská, Maryna V. - Šefčíková, J. - Réblová, Kamila - Schneider, Bohdan - Walter, N.G. - Šponer, Jiří
Cations and hydration in catalytic RNA: Molecular dynamics of the hepatitis delta virus ribozyme.
[Kationy a hydratace katalytických RNA: Molekulární dynamika Hepatitis Delta Virus ribozymu.]
Biophysical Journal. Roč. 91, č. 2 (2006), s. 626-638. ISSN 0006-3495. E-ISSN 1542-0086
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA MŠk(CZ) LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: molecular dynamics * cations * hydration
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.757, rok: 2006
Cations play a crucial role in self-cleavage of the HDV ribozyme, by promoting both folding and chemistry. Here, we analyzed a total of ~200 ns of explicit-solvent molecular dynamics simulations to provide a complementary atomistic view of the binding of monovalent and divalent cations as well as water molecules to reaction precursor and product forms of the HDV ribozyme.
Kationy hrají významnou úlohu v samoštěpení HDV ribozymu, podporující foldování a chemizmus. Analyzovali jsme cca 200 ns explicit-solvent molekulárně dynamických simulací s účelem získat doplňující atomistický pohled na vázání monovalentních a divalentních kationů, tak i molekul do reakčních prekurzorů i produktů (jejich forem) HDV ribozymu.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0134104
Počet záznamů: 1