Počet záznamů: 1
nef gene sequence variation among HIV-1-infected African children
- 1.0044801 - ÚMG 2007 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Chakraborty, R. - Reiniš, Milan - Rostron, T. - Philpott, S. - Dong, T. - D'Agostino, A. - Musoke, R. - de Silva, E. - Stumpf, M. - Weiser, B. - Burger, H. - Rowland-Jones, S.L.
nef gene sequence variation among HIV-1-infected African children.
[Sekvenční variace genu nef u afrických dětí nakažených HIV.]
HIV Medicine. Roč. 7, č. 2 (2006), s. 75-84. ISSN 1464-2662. E-ISSN 1468-1293
Grant ostatní: Fogarty International Center, NIH(US) 3D43TW00915; NIH(US) RO1 AI 42555
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520514
Klíčová slova: HIV-1 nef gene * non-clade B * Kenya
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.674, rok: 2006
There are few data on African children infected with nonclade B HIV-1 in endemic settings, which limits generalizations about pathogenesis and progression. Genotypic and phenotypic variations in host immunogenetics and HIV-1 negative factor (nef) accessory protein may influence disease progression and have frequently been characterized in subjects infected with clade B HIV-1. In this descriptive study, we report nef gene sequence variation and host genetic polymorphisms in 32 Kenyan children, including 12 slow progressors. RESULTS: Phylogenetic analysis identified HIV-1 clades A, C and D and a recombinant A/D subtype. Grossly defective nef genes or significant changes from relevant clade reference sequences were not identified in children with delayed disease progression. CONCLUSIONS: nef sequence variations may not be common in perinatally infected African children. Further studies are warranted in HIV-1-infected subjects in settings where infection is endemic.
Dosud není mnoho informací o afrických dětech infikovaných non-B sybtypy HIV-1. HIV-1 negativní faktor (nef) potein byl popsán jako faktor ovlivňující průběh onemocnění a jeho variance byly popsány většinou v subjektech infikovaných HIV-1 subtypem B. V této studii byly charakterizovány sekvenční variace a genetický polymorfismus v hostitelích u 32 keňských dětí včetně 12 subjektů s pomalou progresí onemocnění. Fylogenetická analýza ukázala, že HIV-1 izoláty patřily k subtypům A, C, D a jeden byl rekombinantní A/D. Žádné významné delece v nef genech nebo signifikantní odlišnosti od referenčních sekvencí příslušných subtypů nebyly identifikovány u dětí s pomalou progresí onemocnění. Tyto výsledky ukazují, že variace v genu nef nejsou běžné v perinatálně infikovaných dětech v Africe.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0137499
Počet záznamů: 1