Nonrandom representation of sex-biased genes on chicken z chromosome

0048517 - ÚMG 2007 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Štorchová, Radka - Divina, Petr
Nonrandom representation of sex-biased genes on chicken z chromosome.
[Nenáhodné zastoupení genů spojených s určením pohlaví na kuřecím chromozomu.]
Journal of Molecular Evolution. Roč. 63, č. 5 (2006), s. 676-681. ISSN 0022-2844. E-ISSN 1432-1432
Grant CEP: GA MŠMT 1M0520
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520514
Klíčová slova: chicken chromosome * sex-biased genes
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.767, rok: 2006

Several lines of evidence suggest that the X chromosome has an unusual complement of genes with sex-biased or sex-specific expression. However, the study of the X chromosome gene content in different organisms provided conflicting results. The most striking contrast concerns the male-biased genes, which are almost depleted from the X chromosome in Drosophila but overrepresented on the X chromosome in mammals. To elucidate the reason for these discrepancies, we analysed the gene content of the Z chromosome in chicken. Our analysis of the publicly available expressed sequence tags (EST) data and genome draft sequence revealed a significant underrepresentation of ovary-specific genes on the chicken Z chromosome. For the brain-expressed genes, we found a significant enrichment of male-biased genes but an indication of underrepresentation of female-biased genes on the Z chromosome. Comparison of X and Z chromosome gene contents provides new insight into evolution of sex chromosomes.

Je známo, že chromosom X nese nenáhodný obsah genů s preferenční či výlučnou expresí v jednom pohlaví. Studie genového obsahu chromosomu X u různých organismů však přinesly rozporuplné výsledky. Nejnápadnější rozpor se týkal genů s preferenční expresí v samčích tkáních, které se téměř nevyskytují na chromosomu X u drozofily, ale jsou nadměrně zastoupené na chromosomu X u savců. Abychom objasnili příčiny těchto nesrovnalostí, analyzovali jsme genový obsah chromosomu Z u kura domácího. Naše analýza veřejně dostupných expresních dat (expressed sequence tags – ESTs) a genomové sekvence odhalila signifikantní ochuzení chromosomu Z o geny specifické pro vaječníky. Dále jsme zjistili ochuzení chromozomu Z o geny s preferenční expresí v samičím mozku, zatímco geny přednostně exprimované v samčím mozku byly na chromozomu Z nadměrně zastoupené. Porovnání genového obsahu chromosomů X a Z poskytuje nový pohled na evoluci pohlavních chromosomů.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0139138