Genomic analysis of HIV type 1 strains derived from a mother and child pair of long-term nonprogressors

0091832 - ÚMG 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Reiniš, Milan - Weiser, B. - Kuiken, C. - Dong, T. - Lang, D. - Nachman, S. - Zhang, Y. - Rowland-Jones, S. - Burger, H.
Genomic analysis of HIV type 1 strains derived from a mother and child pair of long-term nonprogressors.
[Genová analýza HIV-1 virových kmenů izolovaných od matky a jejího dítěte, dlouhodobě non-progresorů.]
Aids Research and Human Retroviruses. Roč. 23, č. 2 (2007), s. 309-315. ISSN 0889-2229. E-ISSN 1931-8405
Grant ostatní: U.S. National Institue of Allergy and Infectious Disease(US) RO1-AI-42555; Fogarty International Center, the National Institute on Drug Abuse, and the National Heart Lung and Blood Institute(US) D43 TW000233
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520514
Klíčová slova: HIV-1 * genomic analysis
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.022, rok: 2007

To investigate the viral features of long-term nonprogressive HIV-1 infection and the selection of viral genomes, we studied serial complete HIV-1 sequences obtained from a mother-child pair, both long-term nonprogressors. Analysis of four genomic sequences demonstrated that all viral genes were intact, lacking major deletions or premature stop codons to easily explain the slow disease progression. These data suggest that viral attenuation, if present, was caused by subtle sequence variations or virus-host interactions. We demonstrated that the daughter's strains were most likely subjected to immunoselection or immunoediting according to the presence of novel MHC class I alleles that differed between mother and daughter. An analysis of nef-specific cytotoxic T-lymphocyte responses in the child, whose HIV-1 nef sequence differed from the maternal nef, supported this interpretation.

Při dlouhotrvající infekci virem HIV-1 bez projevu onemocnění byly u matky a jejího dítěte zjišťovány rozdíly v genomu infikujících virů. Bylo zjištěno, že u prověřovaných kmenů nedošlo ke změnám, které by oslabily jejich účinnost a že atenuace onemocnění je způsobena pravděpodobně interakcí virů a imunitního systemu hostitele.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0152334