Příprava a uchování vzorků ryb pro průtokovou cytometrii

0502504 - ÚBO 2019 RIV CZ cze L3 - Certifikované metodiky
Halačka, Karel - Vetešník, Lukáš - Mareš, J.
Příprava a uchování vzorků ryb pro průtokovou cytometrii.
[Preparation and storage of fish samples for flow cytometry.]
Interní kód: 978-80-7509-582-4 ; 2018
Technické parametry: Metodika je vydána v tištěné podobě, má přiděleno ISBN 978-80-7509-582-4. Číslo osvědčení 53020/2018 - MZE - 16232.
Ekonomické parametry: Pro uživatele metodiky dojde k omezení nákladů na analýzy nečitelných vzorků – i když jsou náklady na analýzu jednoho vzorku ve srovnání s jinými molekulárně-genetickými metodami poměrně nízké, přesto představují sumu cca 30 – 50 Kč (jednorázové speciální jednorázové zkumavky, sítka, barvící a čistící roztoky, obsluha přístroje). U skupiny několika desítek analyzovaných vzorků to tak znamená ztrátu i několika tisíc korun. V případě znalostí o možnostech fixáže, lze minimalizovat náklady spojené s odběrem vzorků, zejména jsou-li spojeny s odchovem jedinců, exkurzí či náročný odlovem. Špatná interpretace výsledků může mít následně významný dopad na účel, kvůli němuž byly analýzy realizovány, ať již se jedná o produkční účely či vědecký výzkum. Celkový ekonomický přínos pro uživatele metodiky lze odhadnout podle počtu analyzovaných vzorků a náročnosti na jejich získávání a laboratorní zpracování na několik desítek tisíc korun ročně.
Certifikační orgán: Ministerstvo zemědělství, Praha, ČR. Datum certifikace: 13.09.2018
Grant CEP: GA TA ČR TG03010048; GA MZe QJ1510077
Institucionální podpora: RVO:68081766
Klíčová slova: Fish farming * DNA analyses * erythrocytes
Obor OECD: Fishery
http://www.rybarstvi.eu/pub%20rybari/metodika%20vzorky.pdf

Průtoková cytometrie umožňující rychlé měření obsahu DNA buněk našla široké využití v ichtyologii i rybářské praxi. Cílem metodiky je přispět k optimalizaci práce na průtokovém cytometru a to pomocí při výběru, odběru a možností fixace analyzovaná tkáně a interpretace získaných dat. Cílovou skupinou dané metodiky jsou zejména osoby z rybářské praxe a ichtyologové zabývající se problematikou populační struktury ryb ve volných vodách, s čímž souvisí i například omezená možnost fixačních prostředků a technik, případně snaha analýz materiálu původně neuchovaného pro účely stanovení ploidie (dočasné pracovní či archivní preparáty, muzejní materiál, atd.). Při výběru druhů k ověření byly preferovány představitelé polyploidních komplexů či hospodářsky využívané druhy se známou existencí polyploidních jedinců.

Flow cytometry enabling rapid measurement of cellular DNA content has been widely used in ichthyology and fishery practice. The aim of the methodology is to contribute to optimization of work on the flow cytometer by helping with the selection, sampling and possibilities of fixation of analyzed tissue and interpretation of obtained data. The target group are people from fishery companies and ichthyologists dealing with the problem of the fish population structure in free water. During the sampling and analyzing of samples problem can be limited availability of fixative and techniques as well as analyzes of material not originally retained for the purpose of ploidy determination. Typical examples are temporary usable or archive preparations, museum material, etc. For the verification were preferred representatives of polyploid complexes or economically exploited species with a known existence of polyploid individuals.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0294484