Universitat Pompeu Fabra
Campillo Grau, María Mercedes
Caltabiano, Gianluigi
2015-12-14
154 p.
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
ABC (ATP-binding cassette) transporters are involved in translocate a wide spectrum of molecules across the lipid bilayer and some of them are associated with various diseases. They also have an important role in multidrug resistance (MDR) in cancer, which has been a major obstacle in cancer chemotherapy and in the treatment of leishmaniasis. While diverse transporters may confer MDR phenotype in bacteria, in human it is mainly achieved by five ABC proteins, among them P-glycoprotein/(ABCB1). To understand the structural basis of P-gp inhibitory activity, to determine the ligand binding sites within P-gp and to guide the design of more potent P-gp inhibitors, we performed i) a 3D-QSAR model using CoMSIA on a set of sesquiterpenes, ii) molecular docking simulations of various compounds in a homology model of LMDR1, a P-gp-like transporter belonging to the Leishmania ABC family and iii) and a complete study of sesquiterpenes interaction with human P-gp.
Los transportadores ABC (ATP binding cassette), encargados de transportar un amplio espectro de moléculas a través de la bicapa lipídica, pueden estar asociados con diversas enfermedades. Juegan un papel importante en la multirresistencia a fármacos (MDR), obstáculo importante en la quimioterapia del cáncer y en el tratamiento de leishmaniasis. En bacterias varios transportadores pueden conferir el fenotipo MDR, en humanos son principalmente cinco, entre ellos la glicoproteína P/(ABCB1). Para comprender la base estructural de la actividad inhibidora de P-gp, determinar los sitios de unión de los ligandos a P-gp y diseñar inhibidores de P-gp más potentes, se realizó i) un modelo 3D-QSAR usando CoMSIA en un conjunto de sesquiterpenos, ii) simulaciones de acoplamiento molecular de varios compuestos en un modelo de homología de LMDR1, transportador de la P-gp perteneciente a la familia ABC de Leishmania y iii) un estudio completo de interacción entre sesquiterpenos y la P-gp humana.
Bioquimica; Diseño con ayuda de ordenador; P-glycoprotein; Transportadores ABC; Sesquiterpenes; Biochemistry; Computer aided drug design; P-glycoprotein; ABC transporters
577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
