Kbrn Uygulamaları İçin Yeni Nesil Algılama Sistemlerinin Geliştirilmesi

2011-12-31
Proje kapsamında terörist eylemler gibi kasıtlı, endüstriel kazalar gibi insan aktiviteleri sonucunda veya doğal nedenlerle ortaya çıkabilecek biyolojik kirlenmelerin tespit ve tanısına yönelik DNA tabanlı sistemlerin geliştirilmesi kapsamında çalışmalar yapılmıştır. İlk aşamada hedef mikroorganizmalarda tespit amaçlı kullanılacak özgün gen bölgeleri biyoenformatik yöntemler kullanılarak belirlenmiş ve belirlenen bu hedef DNA bölgelerinin PZR yöntemi ile çoğaltılabilmesi için özgün primerler tasarlanmıştır. Ayrıca çip için gerekli prob setleri geliştilmiştir. Test amaçlı olarak hedef bölgelerinin sentetik DNA’ları cam yüzey üzerinde DNA çipi formatında denenmişlerdir. Bu denemede biyolojik harp ajanı olarak kullanılabilecek Bacillus anthracis ve aynı zamanda gıda patojeni olarak da sıklıkla karşılaşılan Escherichia coli O157:H7, Salmonella typhimurium ve Vibrio cholerae sentetik hedef bölge nükleik asitleri kullanılmıştır. Projeye ilişkin gelişme raporunda da ayrıntılı olarak belirtildiği üzere projenin ilk 12 aylık bölümü öngörülen sonuçlar alınarak takvime uygun olarak tamamlanmıştır. Projenin devamında öncelikle DNA hedef bölgelerine ait sentetik nükleik asitlerle gerçekleştirilecek sandviç hibridizasyon platformunun cam kapiler sisteme entegre edilmesi için optimizasyon çalışmaları gerçekleştirilecektir. Ardından DNA hedef bölgelerinin PZR yöntemi ile genomik DNA’dan çoğaltılması çalışmalarına geçilecektir. PZR optimizasyonlarının tamamlanmasının ardından elde edilen PZR ürünleri cam kapiler sisteme entegre edilerek gerçek hedef bölgelerle sandviç hibridizasyon platformu kurulacaktır. Projenin son aşamasında ise aynı örnek içerisinde birden fazla mikroroganizma varlığının tespit ve tanısına yönelik çoklu kapiler sistem prototipi geliştirilecektir.

Suggestions

İletken Kopolimer Bazlı Alkol Biyosensörleri Geliştirilmesi
Toppare, Levent Kamil; Erel Göktepe, İrem; Çırpan, Ali; Asil Alptekin, Demet; Danışman, Mehmet Fatih; Önal, Ahmet Muhtar; Esentürk, Okan; Hacaloğlu, Jale(2018-12-31)
Biyolojik malzemelerin seçimli ve doğru analizleri için analitik cihazların geliştirilmesi biyoteknoloji alanında büyük bir ilgi görmekte olup biyolojik sistemlerin ticari bir potansiyele de sahip olması bu alandaki çalışmaları hızlandırmıştır. En büyük problem biyolojik datanın ölçülebilir bir sinyal haline dönüştürülme aşamasıdır. Alkol analizi endüstriyel gıda laboratuarlarında, mayalama endüstrisinde, ilaç endüstrisinde ve klinik analizlerde çok önemlidir. Alkol tayini için kullanılan birçok farklı tekn...
Havacılık Nöroergonomisinde Optik Beyin Görüntüleme Uygulamaları
Çakır, Murat Perit (2021-06-01)
Pilotların, insansız hava aracı operatörlerinin, hava trafik kontrolörlerinin eğitim ve uçuş faaliyetleri sırasında bilişsel durumlarının takibini sağlayacak nesnel yöntemlerin geliştirilmesi uçuş emniyetinin sağlanması, eğitim süreçlerinin optimizasyonu ve yenilikçi insan-makine arayüzlerinin tasarımı bakımından kritik önem taşımaktadır. İşlevsel Yakın-Kızılötesi Tayfölçümü (functional near infrared spectroscopy – fNIRS) optik beyin görüntüleme teknolojisi gibi saha kullanımına uygun, portatif ve güvenilir...
Elektronik Öğrenme Tasarım İlkelerinin EEG Verileri ile Doğrulanması: Deneysel Çalışma
Yıldırım, İbrahim Soner; Özkurt, Tolga Esat(2016-12-31)
Bu çalışmanın amacı çoklu ortam, bitişiklik, kanal, fazlalık, tutarlılık ve kişileştirme ilkeleri kullanılarak üniveriste lisans düzeyindeki Fizik dersine yönelik tasarlanan elektronik öğrenme materyallerinin etkilliğinin EEG verileri vasıtasıyla dikkat, ilgilenme, ilgi, heyecan duyma, alaka, rahatlama ve gerilim düzeyleri üzerinden doğrulamaktır. Deneysel araştırma deseninin kullanılacağı çalışmada, her bir tasarım ilkesi için deney ve kontrol gruplarında bulunan toplam 30 öğrenciden EEG cihazı ile verile...
Karmaşık biyolojk sistemlerin deterministik modellemelerinde alternatif yaklaşımlar, parametre tahmini ve kopulalar
Weber, Gerhard Wilhelm; Purutçuoğlu, Eda; Purutçuoğlu Gazi, Vilda; Ayyildiz, Ezgi; Akal, Tülay; Şeker, Tamay; Seçilmiş, Deniz(2016-12-31)
Proje, karmaşık biyolojik ağların deterministik modellenmesi ve parametre tahmininde, literatürde var olan ve sıklıkla kullanılan Gaussian grafiksel modele ve adi diferansiyel denklemler modeline alternatif yeni modeller sunmakta, adı geçen yaygın modellerin hesaplamalardaki varsayım ve sonuçlarında görülen eksiklik ve kısıtlarının çözümüne bir öneri getirmektedir. Bu amaçla, proje, parametrik olmayan ve farklı disiplinler ve amaçlar için kullanılan algoritma ve modelleri, biyolojik sistemlerin tahmininde...
Blockchain-Based Data Security in Military Autonomous Systems
Angın, Pelin (2020-11-01)
Advances in technology have enabled the increased use of autonomous systems such as unmanned aerial vehicles (UAVs) in military operations and other critical military communications. While the use of autonomous systems has greatly facilitated military operations, provided a global view of the operational environment and eased sensitive data collection, making possible reduced casualties, it has also created a greater cyber attack surface due to its high level of automation. The existence of adversaries targ...
Citation Formats
H. A. Öktem, “Kbrn Uygulamaları İçin Yeni Nesil Algılama Sistemlerinin Geliştirilmesi,” 2011. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/61793.