Teoretické studium interakčních modelů dirhodiových komplexů.
The theoretical exploration of the interactions of dirhodium complexes.
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/13699Identifikátory
SIS: 45846
Kolekce
- Kvalifikační práce [10697]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Sychrovský, Vladimír
Oponent práce
Záliš, Stanislav
Fakulta / součást
Matematicko-fyzikální fakulta
Obor
Biofyzika a chemická fyzika
Katedra / ústav / klinika
Katedra chemické fyziky a optiky
Datum obhajoby
11. 9. 2007
Nakladatel
Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Táto práca je zameraná na štúdium interakcií komplexu Diaqua-tetrakis(-acetylato)dirhodium(II,II). Tento komplex patrí medzi zlúčeniny tranzitívnych kovov, ktoré preukázali aktivitu pri liečbe nádorových ochorení. Študované sú interakcie tohto komplexu s amoniakom a s guanínom. V prvom prípade ide o substitúciu kyslíka acetylu viazaného na atóm ródia, alebo vody viazanej na ten istý atóm, amoniakom. V druhom prípade je substituovaná väzba ródia s vodou za väzbu s guanínom. Ten sa na ródium viaže buď atómom kyslíka O6 alebo atómom dusíka N7. Optimalizácie sú spočítané na úrovni DFT v báze 6-31G*. V prípade substitučných reakcií s amoniakom boli nájdené tranzitívne stavy, vykonaná nábojová analýza NPA, termodynamické a kinetické analýzy. Tieto analýzy boli vykonané na úrovni DFT s bázou aug-cc-pvdz. Na popis atómov ródia bola použitá pseudobáza a pseudopotenciál. Všetky výpočty boli vykonané v "gas phase".
This work focuses on the study of interactions of the Diaqua-tetrakis(-acetylato)dirhodium(II,II) complex. This complex belongs to compounds of transition metals, which show activity in anticancer treatment. In this work, the interactions of this complex with ammonia and guanine are studied. The interactions with ammonia are represented by a replacement reaction of oxygen from acetyl ligand or aqua ligand. Another reaction is the replacement of water bonded to rhodium by guanine. Guanine can form a bond to rhodium with oxygen O6 or nitrogen N7. Optimization of the structures are made at the DFT level with 6-31G* basis set. For reactions with ammonia transition states were found. NPA charge analyses, thermodynamical and kinetical analyses were performed. All these analyses were done at the DFT level with aug-cc-pvdz basis set. To describe the electronic structure of rhodium atoms pseudopotentials and pseudobasis were used. All calculations were modeled in gas phase.