Orientadores: Anete Pereira de Souza, Antonio Augusto Franco Garcia

Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia

Resumo: Conhecer a variabilidade genética de plantas de interesse econômico permite manipular recursos naturais de forma eficiente, visando o melhoramento vegetal. A milho é uma das mais importantes plantas cultivadas e a diversidade que o germoplasma tropical apresenta ainda não está bem...

Resumo: Conhecer a variabilidade genética de plantas de interesse econômico permite manipular recursos naturais de forma eficiente, visando o melhoramento vegetal. A milho é uma das mais importantes plantas cultivadas e a diversidade que o germoplasma tropical apresenta ainda não está bem estabelecida. Atualmente, os marcadores moleculares são a principal maneira de analisar essa diversidade, e muitas possibilidades estatísticas foram desenvolvidas para organizar informações de dados moleculares. Este trabalho usou os marcadores AFLP e SSR para avaliar a diversidade genética em linhagens de milho tropical pertencentes ao Banco de Germoplasma do Instituto Agronômico de Campinas (IAC), e revelou grande nível de variabilidade. Os três tipos de coeficiente usados (Jaccard, MRD e coeficiente de parentesco molecular) exibiram baixos valores de similaridade entre as linhagens e, dependendo do marcador usado, diferentes agrupamentos foram obtidos. Entretanto, altas correlações entre as matrizes geradas por Jaccard e pelo coeficiente de parentesco molecular com AFLP, SSR e AFLP/SSR foram observadas. As correlações entre AFLP e SSR foram baixas, independentemente do coeficiente de similaridade aplicado. Devido à habilidade dos SSRs em revelar vários aspectos da variação genômica, essa técnica foi considerada mais apropriada para análises de diversidade. Notou-se que a grande diversidade existente no material tropical levou a resultados distintos se marcadores diferentes foram usados, e que o uso simultâneo de AFLPs e SSRs pode não ser a maneira mais eficiente de avaliar a variabilidade em materiais altamente divergentes

Abstract: Knowledge about genetic variability of agronomically important crops allows efficient manipulation of resources in order to achieve plant improvement. Maize is one of the most important crops, but the extent of its diversity in the tropical germplasm has still not been well established....

Abstract: Knowledge about genetic variability of agronomically important crops allows efficient manipulation of resources in order to achieve plant improvement. Maize is one of the most important crops, but the extent of its diversity in the tropical germplasm has still not been well established. Nowadays, molecular markers are the principal way of analyzing genetic diversity and many statistical possibilities have been developed to compile data from molecular assays. This work used AFLP and SSR markers to access genetic diversity in tropical maize inbred lines from the Maize Genebank of the Agronomic Institute of Campinas (IAC), and revealed a great level of variability, with high rates of polymorphism. All three types of coefficients applied (Jaccard, MRD and molecular coefficient of coancestry) exhibited very low genetic similarities among the inbreds, and depending on the marker used, different clusters were obtained. Nevertheless, high correlations between matrices generated by Jaccard and by the molecular coefficient of coancestry with AFLP, SSR and AFLP/SSR were seen. AFLP and SSR were poorly correlated with both similarity coefficients. Because of SSR's ability of uncovering many aspects of genomic variation, it was considered more appropriate for diversity analysis. It was observed that the great amount of diversity found in tropical maize led to distinct results with different markers, and that using both AFLP and SSR together may not be the most efficient manner of accessing variability in highly diverse materials