Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-CoV-2
Само за регистроване кориснике
2021
Мастер/магистарски рад (Објављена верзија)
,
Univerzitet u Beogradu - Hemijski fakultet
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Lančana reakcija polimerazacije sa reverznom transkripcijom u realnom vremenu (RT-qPCR) je najsenzitivniji i najspecifičniji test za laboratorijsku dijagnostiku SARS-CoV-2 infekcije i predstavlja “zlatni standard”. Cilj ovog rada je poređenje i analiza performansi tri različita komercijalna kita za detekciju SARS-CoV-2 virusa (Sansure Biotech, GeneFinderTM i TaqPathTM) metodom RT-qPCR na 354 nasumično izabrana uzorka hospitalizovanih pacijenata sa COVID-19. Ekstrakcija RNK iz uzoraka je urađena na automatskom ekstraktoru NC-15 plus (ALPHAGENE Co., Ltd.) prema uputstvu proizvođača. Sve PCR reakcije su izvedene korišćenjem istih RNK izolata na jednom PCR aparatu (Applied Biosystems). Rezultati pokazuju veliku sličnost u analitičkoj osetljivosti testova za detekciju SARS-CoV-2 virusa, što ukazuje da je dijagnostička tačnost ova tri testa uporediva. Međutim, SanSure Biotech kit pokazao je bolje dijagnostičke performanse u odnosu na druga dva testa. Naši rezultati takođe upućuju i da je u c...iju poboljšanja osetljivosti testova neophodno modifikovati prajmere za PCR reakciju zajedno sa pojavom novih varijanti virusa.
Кључне речи:
SARS-CoV-2 / COVID-19 / real-time PCR / PCR testovi / dijagnostička efikasnost / RNKИзвор:
2021, 2-35Колекције
Институција/група
Hemijski fakultet / Faculty of ChemistryTY - THES AU - Petrović, Gordana PY - 2021 UR - https://cherry.chem.bg.ac.rs/handle/123456789/4634 AB - Lančana reakcija polimerazacije sa reverznom transkripcijom u realnom vremenu (RT-qPCR) je najsenzitivniji i najspecifičniji test za laboratorijsku dijagnostiku SARS-CoV-2 infekcije i predstavlja “zlatni standard”. Cilj ovog rada je poređenje i analiza performansi tri različita komercijalna kita za detekciju SARS-CoV-2 virusa (Sansure Biotech, GeneFinderTM i TaqPathTM) metodom RT-qPCR na 354 nasumično izabrana uzorka hospitalizovanih pacijenata sa COVID-19. Ekstrakcija RNK iz uzoraka je urađena na automatskom ekstraktoru NC-15 plus (ALPHAGENE Co., Ltd.) prema uputstvu proizvođača. Sve PCR reakcije su izvedene korišćenjem istih RNK izolata na jednom PCR aparatu (Applied Biosystems). Rezultati pokazuju veliku sličnost u analitičkoj osetljivosti testova za detekciju SARS-CoV-2 virusa, što ukazuje da je dijagnostička tačnost ova tri testa uporediva. Međutim, SanSure Biotech kit pokazao je bolje dijagnostičke performanse u odnosu na druga dva testa. Naši rezultati takođe upućuju i da je u ciju poboljšanja osetljivosti testova neophodno modifikovati prajmere za PCR reakciju zajedno sa pojavom novih varijanti virusa. T1 - Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-CoV-2 SP - 2 EP - 35 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4634 ER -
@mastersthesis{ author = "Petrović, Gordana", year = "2021", abstract = "Lančana reakcija polimerazacije sa reverznom transkripcijom u realnom vremenu (RT-qPCR) je najsenzitivniji i najspecifičniji test za laboratorijsku dijagnostiku SARS-CoV-2 infekcije i predstavlja “zlatni standard”. Cilj ovog rada je poređenje i analiza performansi tri različita komercijalna kita za detekciju SARS-CoV-2 virusa (Sansure Biotech, GeneFinderTM i TaqPathTM) metodom RT-qPCR na 354 nasumično izabrana uzorka hospitalizovanih pacijenata sa COVID-19. Ekstrakcija RNK iz uzoraka je urađena na automatskom ekstraktoru NC-15 plus (ALPHAGENE Co., Ltd.) prema uputstvu proizvođača. Sve PCR reakcije su izvedene korišćenjem istih RNK izolata na jednom PCR aparatu (Applied Biosystems). Rezultati pokazuju veliku sličnost u analitičkoj osetljivosti testova za detekciju SARS-CoV-2 virusa, što ukazuje da je dijagnostička tačnost ova tri testa uporediva. Međutim, SanSure Biotech kit pokazao je bolje dijagnostičke performanse u odnosu na druga dva testa. Naši rezultati takođe upućuju i da je u ciju poboljšanja osetljivosti testova neophodno modifikovati prajmere za PCR reakciju zajedno sa pojavom novih varijanti virusa.", title = "Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-CoV-2", pages = "2-35", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4634" }
Petrović, G.. (2021). Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-CoV-2. , 2-35. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4634
Petrović G. Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-CoV-2. 2021;:2-35. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4634 .
Petrović, Gordana, "Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-CoV-2" (2021):2-35, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4634 .