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http://hdl.handle.net/10362/163432
Título: | Caracterização e distribuição da microbiota gástrica obtida por citologia esfoliativa numa coorte portuguesa |
Autor: | Ferreira, Susana Maria Alves |
Orientador: | Marques, Cláudia Sofia Fonseca Ismael, Shámila |
Palavras-chave: | Gastric microbiota 16S rRNA exfoliative cytology Helicobacter pylori |
Data de Defesa: | 1-Fev-2024 |
Resumo: | ABSTRACT
Introduction: The stomach is considered an extremely hostile environment and seen, until
recently, as a sterile sanctuary and protective barrier for the most distal digestive tract. Although
scarce, studies have emerged with identification of the gastric microbiota and its contribution to
human health, including the pathogenesis of Helicobacter pylori as a potentiator or protector of
inflammation. To date, gastric microbiota has been assessed by biopsies or gastric fluid which
represent limitations by being too invasive or inaccurately representing the mucosal profile.
Exfoliative cytology may represent an alternative that can counteract these limitations.
Therefore, this study aimed to characterize the gastric microbiota in a Portuguese cohort by
exfoliative cytology sample collection.
Methodology: Participants were recruited as Hospital do SAMS Endoscopy Unit, samples were
taken during upper digestive endoscopy from the fundus, body and antrum by exfoliative
cytology, then frozen and subsequently processed for DNA extraction and sequencing for the 16S
rRNA gene.
Results: Fifty participants were eligible, 76% female, aged 52.80±1.47 years. 32% had dyspeptic
symptoms, 93% had mild histological lesion and 28% had Helicobacter pylori. The location with
the greatest bacterial abundance was the antrum. The most abundant phyla, in the three
locations, were Bacteroidetes, Proteobacteria and Firmicutes and the most abundant genera in
the three locations were Prevotella, Streptococus, Haemophilus, Neisseria and Yersinia. The a-
Diversity assessment did not show differences between regions, nor did the b-Diversity
assessment. Assessment of microbiota and Helicobacter pylori status revealed subjects in Hp+
group had lower abundance in all stomach locations and b-Diversity differed between Hp+/Hpgroups
at the genera level.
Conclusion: gastric microbiota profile seems closer to the intestinal microbiota and differs
between Hp+ and Hp- groups. Hp infection was accompanied by a reduction in absolute
abundance in all locations.
Proteobacteria was one of the most abundant phyla, but not at the expense of genera
Helicobacter. Exfoliative cytology demonstrated efficacy to characterize gastric microbiota and
can be used as a less invasive sample collection method. The collection site is not a limitation,
althougt the antrum shows greater absolute abundance, there are no differences in diversity
between gastric locations.
There was a greater richness in the group with low adherence to the mediterranean diet. RESUMO Introdução: O estômago é considerado um meio extremamente hostil e visto, até recentemente, como um santuário estéril e uma barreira de proteção para o tubo digestivo mais distal. Embora escassos, alguns estudos comprovaram a existência da microbiota gástrica e a sua contribuição para a saúde, incluindo um papel potenciador ou protetor da inflamação induzida pela infeção do Helicobacter pylori. Até à data, o método de colheita de microbiota gástrica tem sido a biópsia gástrica ou o suco gástrico tendo como limitação serem muito invasivos ou pouco representativos do perfil mucoso. A citologia esfoliativa pode representar uma alternativa aos métodos descritos. Desta forma este estudo propõe-se caracterizar a microbiota gástrica numa coorte portuguesa com colheita de amostras por citologia esfoliativa. Metodologia: Os participantes foram recrutados na Unidade de Endoscopia do Hospital do SAMS. Foram colhidas as amostras por citologia esfoliativa durante a endoscopia digestiva alta no fundo, corpo e antro; depois congeladas e posteriormente processadas para extração de ADN e sequenciação para o gene 16S rRNA. Resultados: Entre os 50 participantes elegíveis, 76% eram do sexo feminino, a idade média era de 52±1,47 anos, 32% referiram sintomas dispépticos, 93% tinham lesões histológicas ligeiras e 28% com Helicobater pylori. A localização com maior abundância foi o antro. Os filos mais abundantes, nas três localizações, foram Bacteroidetes, Proteobacteria e Firmicutes e os géneros mais abundantes, nas três localizações, foram Prevotella, Streptococus, Haemophilus, Neisseria e Yersinia. A avaliação da a-Diversidade, não mostrou diferenças entre as regiões nem a avaliação da b-Diversidade. A avaliação da microbiota e o status Helicobacter pylori revelou que o grupo Hp+ tinha menor abundância em todas as localizações gástricas e a b-Diversidade mostrou diferenças entre os grupos Hp+/Hp- ao nível do género. Conclusão: O perfil da microbiota gástrica aparenta uma proximidade com o intestinal e é diferente entre os grupos com e sem infeção por Hp. A infeção pelo Hp acompanhou-se da redução de abundância absoluta em todas as localizações. O filo Proteobacteria foi um dos mais abundantes, mas não à custa do género Helicobacter. A citologia esfoliativa demonstrou eficácia em caracterizar a microbiota gástrica e pode ser utilizado como um método de colheita menos invasivo. O local de colheita não constitui limitação, apesar do antro mostrar maior abundância absoluta não existem diferenças de diversidade entre as localizações gástricas. Verificou-se maior riqueza no grupo com baixa adesão à dieta mediterrânica. |
URI: | http://hdl.handle.net/10362/163432 |
Designação: | Nutrição Humana e Metabolismo |
Aparece nas colecções: | NMS - Dissertações de Mestrado em Nutrição |
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