Genotipagem de HLA para avaliação de risco de infeção por SARS-Cov-2

Abstract

Introdução: Em dezembro de 2019, foi identificado um novo coronavírus na China. Este foi denominado SARS-CoV-2 e a doença associada designou-se COVID-19. Atualmente já são reconhecidos fatores de risco para o desenvolvimento de uma forma mais grave desta doença. No entanto, a gravidade desta não está apenas associada à infeção viral em si, mas também está relacionada com a resposta imunitária do hospedeiro ao SARS-CoV- 2. Neste contexto, o sistema HLA tem um papel fundamental na regulação da resposta imune. Estão descritos diversos polimorfismos nos genes HLA associados a infeções virais, incluindo SARS-CoV-2. Objetivos: Caracterizar uma população de Viseu com registo prévio de infeção por SARS-CoV-2 e genotipar os seus alelos HLA, para eventualmente identificar variantes genéticas de HLA associadas à infeção. Materiais e Métodos: Estudo de investigação laboratorial com aplicação de um questionário e colheita de uma amostra biológica de saliva. Os participantes foram alunos e pacientes da Clínica Dentária Universitária da UCP e pacientes da JS Clínica Médica Lda., em Viseu. As amostras foram processadas para determinar a carga viral e identificar alterações nos genes HLA, de modo a relacionar estes polimorfismos com o grau de desenvolvimento de COVID-19. Resultados: As frequências dos diferentes alelos HLA-A e HLA-B foram analisadas e comparadas entre populações. Os alelos HLA-A*02, HLA-B*44 e HLA-B*51 são os mais frequentes em Viseu e a nível nacional. A caracterização dos indivíduos previamente infetados com SARS-CoV-2 corrobora a diversidade de manifestações clínicas associadas. Foram identificados polimorfismos presentes nos genes HLA-A e HLA-B destes indivíduos. Conclusão: Sabendo a grande influência do sistema HLA nas infeções virais, é imperioso incentivar pesquisas a nível populacional dos alelos HLA de suscetibilidade e de proteção face ao SARS-CoV-2 para que se consiga melhorar a atuação contra a propagação desta pandemia.

Introduction: In December 2019, a new coronavirus was identified in China. It was named SARS-CoV-2 and the associated disease COVID-19. Currently, risk factors for the development of a more severe form of this disease are already recognized. However, the severity is not only associated with the viral infection itself but is also related with the host's immune response to SARS-CoV-2. In this context, the HLA system plays a key role in the immune response’s regulation. Several polymorphisms in HLA genes associated with viral infections, including SARS-CoV-2, have been described. Aims: To characterize a population from Viseu with a previous record of SARS-CoV-2 infection and to genotype its HLA alleles, to eventually identify HLA genetic variants associated with SARS-CoV-2 infection. Materials and Methods: Laboratory research study with questionnaire application and collection of a biological saliva sample. The participants were students and patients from the UCP University Dental Clinic and patients from JS Clínica Médica Lda., in Viseu. The samples were processed to determine viral load and identify changes in HLA genes, to relate these polymorphisms with the COVID-19 severity. Results: The frequencies of the different HLA-A and HLA-B alleles were analyzed and compared between populations. The alleles HLA-A*02, HLA-B*44 and HLA-B*51 are the most frequent in Viseu and in Portugal. The characterization of individuals previously infected with SARS-CoV-2 corroborates the diversity of associated clinical manifestations. Polymorphisms present in HLA-A and HLA-B genes from these individuals were identified. Conclusion: Knowing the wide influence of the HLA system on viral infections, it is imperative to encourage population-level research on HLA susceptibility and protection alleles against SARS-CoV-2 to improve the performance against the spread of this pandemic.