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http://hdl.handle.net/1843/BUOS-B5MKJ3| Type: | Tese de Doutorado |
| Title: | Um estudo sobre o uso da geometria poligonal da cadeia principal como uma assinatura estrutural mais conservada que o empacotamento de resíduos |
| Authors: | Joao Arthur Ferreira Gadelha Campelo |
| First Advisor: | Raquel Cardoso de Melo |
| First Co-advisor: | Sabrina de Azevedo Silveira |
| Abstract: | Mesmo que a função não possa ser diretamente inferida puramente a partir do padrão de enovelamento especíco adotado por uma determinada proteína, os dados estruturais podem ser usados para detectar proteínas com funções semelhantes. Neste contexto, uma estratégia possível é a denição de assinaturas estruturais, que são conjuntos de características capazes de identicar inequivocamente um tipo de enovelamento proteico. O objetivo do corrente trabalho é encontrar possíveis padrões estruturais conservados em proteínas de mesma família. Para demonstrar que um modelo que utiliza as informações posicionais em nível atômico é conservado e discriminativo entre famílias, construiu-se classicadores estruturais. A partir deste estudo, foi possível discriminar os átomos do backbone como a melhor assinatura estrutural estudada. Inserindo pontos intermediários ctícios entre os carbonos alfa, obtêm-se uma poligonal geométrica, similar à poligonal geométrica obtida pela inclusão dos átomos da cadeia principal. Dessa forma, consegue-se um efeito similar à poligonal geométrica da cadeia principal sem a inuência do posicionamento dos átomos CeNe, indiretamente, sem a inuência dos ângulos phi e psi. O corrente estudo sugere que não são as posições desses átomos os fatores determinantes no incremento da precisão da classicação, mas o fortalecimento do caráter geométrico linear da cadeia principal. Portanto, a principal contribuição do presente trabalho é a investigação do uso da disposição geométrica poligonal da cadeia principal (ou dos próprios Cá, caso sejam adicionados pontos intermediários ctícios entre esses) como uma assinatura estrutural discriminativa. |
| Subject: | Bioinformática Proteinas Análise Proteinas Estrutura |
| language: | Português |
| Publisher: | Universidade Federal de Minas Gerais |
| Publisher Initials: | UFMG |
| Rights: | Acesso Aberto |
| URI: | http://hdl.handle.net/1843/BUOS-B5MKJ3 |
| Issue Date: | 6-Jul-2017 |
| Appears in Collections: | Teses de Doutorado |
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