Tecnologia em Informática em Saúde
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- ItemEvidências de recombinação entre variantes SARS-CoV-2 através da análise de sequencias somente brasileiras(Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-21) Bueno, Marcelo [UNIFESP]; Briones, Marcelo Ribeiro da Silva [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/0018992452321910A recombinação viral é um processo genético em que o material genético de duas linhagens diferentes é trocado, levando assim à formação de novas variantes genéticas. Tal ocorrência é mais comum nos vírus de RNA, como o SARS-CoV-2 causador da COVID-19. O processo de recombinação pode ocorrer quando o organismo hospedeiro é infectado por duas variantes diferentes. Durante a replicação, os segmentos de RNA podem ser trocados, resultando em uma combinação de material genético de ambas as cepas, podendo levar à formação de um novo vírus com características genéticas diferentes das cepas parentais originais. Desta forma o que se observa é o fato de que a recombinação viral é uma das causas da rápida evolução dos vírus levando a adquirir novas características, tais como: resistência a medicamentos antivirais; evasão do sistema imunológico; mudanças nas propriedades de transmissão. Vale destacar que, o vírus SARS-CoV-2 vem sofrendo mutações ao longo do tempo, o que levou à formação de novas variantes, sendo a recombinação genética, onde o material genético é trocado entre diferentes cepas do vírus, é um dos mecanismos pelos quais novas variantes podem surgir. Tal Mecanismo inclusive, pode tornar insuficiente a análise evolutiva do SARS-CoV-2 apenas por filogenia, de modo que outras técnicas, tal como PCA, explicam melhor a variação observada nas linhagens virais atuais. Embora a recombinação viral seja um acontecimento comum em vírus de RNA, nem todos os vírus passam por esse processo com a mesma frequência, além disso, nem toda recombinação resultara em variantes viáveis ou que venham a ter um impacto significativo na dinâmica de infecção e ou reinfecção do hospedeiro. Portanto, compreender os eventos de recombinação e rastrear eventos de alterações dos genes auxilia a compreender o comportamento de evolução e infecção deste vírus.
- ItemAplicação de arquitetura REST para implementação de servidor FHIR(Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-21) Melo, Gustavo Rodrigues de [UNIFESP]; Paiva, Paulo Bandiera [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/0947654602498462; https://lattes.cnpq.br/4668471303746128Este trabalho concentra-se na implementação e análise do protocolo FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources), uma especificação de padrões e diretrizes criada para facilitar a troca eficiente e interoperável de informações de saúde eletrônicas. O FHIR desempenha um papel crucial na melhoria da comunicação e do compartilhamento de dados em sistemas de saúde, com o objetivo de aprimorar a acessibilidade e a integração de informações clínicas. Adicionalmente, o estudo explora a arquitetura REST (Representational State Transfer), um estilo arquitetural largamente utilizado em sistemas distribuídos baseados na web. Esta arquitetura baseia-se em princípios como o uso de recursos identificáveis por URLs e operações CRUD (Create, Read, Update, Delete) mapeadas para métodos HTTP específicos, além da troca de informações utilizando representações de recursos em formatos como JSON ou XML. Incorporando a metodologia Extreme Programming (XP) como método de desenvolvimento de software, o projeto visa aliar eficiência e adaptabilidade. A XP, com seu foco em práticas como programação em pares, desenvolvimento orientado a testes e integração contínua, oferece uma abordagem robusta para o desenvolvimento ágil de software, especialmente em ambientes que exigem resposta rápida a mudanças e alta qualidade no produto final. O relatório apresentará o desenvolvimento de um protótipo de software, ilustrando o processo de abstração e construção de uma aplicação que integra o protocolo FHIR com a arquitetura REST, utilizando a metodologia Extreme Programming. O objetivo é fornecer insights valiosos tanto do ponto de vista prático quanto teórico na criação de sistemas de saúde eficientes e interoperáveis. O resultado é a obtenção de um modelo de viabilidade com uma fundamentação teórica sólida, demonstrando a eficácia da XP na melhoria da gestão e troca de informações clínicas, e na entrega de um produto de software que atenda às necessidades dinâmicas do setor de saúde.
- ItemInternet das Coisas no desenvolvimento de tecnologia em saúde(Universidade Federal de São Paulo, 2022) Cardoso, Alessandra Felix [UNIFESP]; Paiva, Paulo Bandiera [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/0947654602498462; http://lattes.cnpq.br/4325198292510186Introdução: "Internet of Things" (loT), conhecida como "Internet das Coisas" é uma tecnologia que colabora para um controle cada vez mais preciso e eficiente dos componentes físicos de maneira digital, permitindo que dados sejam captados por sensores, armazenados em nuvens e comunicados aos seus destinatários por um sistema Web, nesse sentido, transforma ambientes comuns em inteligentes e pode ser aplicado em diversas áreas do conhecimento. Objetivos: Identificar as contribuições, aplicações, desafios e perspectivas futurísticas de loT na área da saúde e durante a pandemia pelo novo coronavírus. Metodologia: Revisão da literatura sistemática, realizada na base de dados PubMed, Scielo e Scopus com critérios de seleção: artigos de até 5 anos de publicação, na língua inglesa, disponíveis na íntegra e que de preferência, já tenham sido citados, com os descritores "Internet of Things" and "Medicine" e "Internet of Things" and "Covid-19". Resultados: A partir da busca "Internet of Things" and "Medicine" foram encontrados um total de 495 artigos, sendo assim distribuídos, PubMed (463), Scielo (2) e Scopus (30) e para a busca "Internet of Things" and "Covid-19" foram encontrados um total de 407 artigos, sendo assim distribuídos, PubMed (229), Scielo (0) e Scopus (178). Todos os títulos e resumos foram lidos e conferidos conforme os critérios de inclusão/exclusão, logo após foram selecionados os de maior clareza, objetividade e relevância, resultando respectivamente pelos descritores supracitados, em 10 e 7 artigos. Conclusões: Houve um considerável aumento dos números de publicações sobre o tema loT e medicina nos anos de 2020 e 2021. Uma das vantagens de loT na área da saúde é a otimização de tempo para equipes médicas tratarem seus pacientes de forma remota, com a facilidade de acesso a seus sinais vitais por meio de aplicativos conectados à internet. Melhoria conhecida é a necessidade de novas soluções para arquivar e manusear o grande volume de dados captados, ampliar o gerenciamento de hardware, software e prestadores de serviços em loT, priorizando a segurança dos dados do paciente.
- ItemBenefits and challenges of open-source health informatics systems: A systematic search of projects and literature review(Universidade Federal de São Paulo, 2020-05-05) Minohara, Gabrielle [UNIFESP]; Meirelles, Paulo [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/2193972715230641; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Os Sistemas de Informática em Saúde (HIS) chamam mais atenção à medida que seus benefícios são explorados e se tornam mais evidentes. A melhoria da assistência ao paciente e da qualidade dos serviços de saúde são exemplos dessas vantagens. No entanto, os sistemas proprietários nem sempre são viáveis devido aos seus altos custos. Investigamos os benefícios e desafios da adoção de Sistemas de Informática em Saúde de Código Aberto (OHIS) discutidos na literatura e também mapeamos os projetos OHIS do mundo real, com suas características técnicas e de sua comunidade. Ambos os resultados nos guiaram a abordar os aspectos que ainda precisam ser superados e também a identificar os critérios que auxiliem gestores e profissionais de TI na escolha do OHIS mais adequado ao contexto. Conduzimos um Estudo de Mapeamento Sistemático para revisar a literatura e também extraímos repositórios de código-fonte de projetos OHIS. Empregamos métodos bem consolidados da comunidade de engenharia de software, e nos diferenciamos de trabalhos semelhantes pelo uso de um método mais sistemático e por avaliar projetos OHIS usando métricas e artefatos de engenharia de software. Encontramos 500 artigos e 151 projetos, selecionando 26 artigos para analisar detalhadamente e minerando 38 repositórios OHIS ativos. Mapeamos os benefícios e desafios na adoção de projetos OHIS e identificamos as características legais e técnicas dos mesmos. Propomos um mapa conceitual para ilustrar a relação entre todos os benefícios de adoção do OHIS. Em seguida, correlacionamos como os artefatos técnicos e documentais de um projeto OHIS afetam os seus benefícios e desafios esperados. Portanto, recomendamos um conjunto de artefatos e métricas, bem estabelecidas na comunidade OSS, como os critérios necessários para avaliar uma solução OHIS de uma perspectiva de engenharia de software.
- ItemDesenvolvimento de um processo de automação para produção de dilatadores vaginais personalizados para impressão 3D(Universidade Federal de São Paulo, 2021-03-01) Yamanaka, Pedro Gabriel [UNIFESP]; Sartori, Marair Gracio Ferreira [UNIFESP]; Chrispin, Thyeres Teixeira Bueno; http://lattes.cnpq.br/1731362217497425; http://lattes.cnpq.br/2545470341657690; http://lattes.cnpq.br/0262896155108078; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Tendo em vista a maior popularização das tecnologias de modelagem tridimensional(3D)e a impressão 3D, junto a uma necessidade de produção de dilatadores vaginais personalizados para o tratamento da Agenesia Vaginal, este trabalho busca elaborar um processo que automatize a personalização de modelos 3D de dilatadores vaginais, com base nos modelos criados pelo pesquisador Chrispin e que permita gerar modelos de dilatadores rapidamente, apenas alterando as variáveis de altura e de diâmetro da peça utilizando princípios de modelagem paramétrica.