Article (Scientific journals)
Innovative methodology for the identification of soluble biomarkers in fresh tissues.
Costanza, Brunella; Turtoi, Andrei; Bellahcene, Akeila et al.
2018In Oncotarget, 9 (12), p. 10665-10680
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Keywords :
biomarkers; metabolomic; miRNAs; proteomic; tDNA
Abstract :
[en] The identification of diagnostic and prognostic biomarkers from early lesions, measurable in liquid biopsies remains a major challenge, particularly in oncology. Fresh human material of high quality is required for biomarker discovery but is often not available when it is totally required for clinical pathology investigation. Hence, all OMICs studies are done on residual and less clinically relevant biological samples. Here after, we present an innovative, simple, and non-destructive, procedure named EXPEL that uses rapid, pressure-assisted, interstitial fluid extrusion, preserving the specimen for full routine clinical pathology investigation. In the meantime, the technique allows a comprehensive OMICs analysis (proteins, metabolites, miRNAs and DNA). As proof of concept, we have applied EXPEL on freshly collected human colorectal cancer and liver metastases tissues. We demonstrate that the procedure efficiently allows the extraction, within a few minutes, of a wide variety of biomolecules holding diagnostic and prognostic potential while keeping both tissue morphology and antigenicity unaltered. Our method enables, for the first time, both clinicians and scientists to explore identical clinical material regardless of its origin and size, which has a major positive impact on translation to the clinic.
Disciplines :
Oncology
Author, co-author :
Costanza, Brunella ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > GIGA-R : Labo de recherche sur les métastases
Turtoi, Andrei 
Bellahcene, Akeila  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > GIGA-R : Labo de recherche sur les métastases
Hirano, Touko
Peulen, Olivier  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Département des sciences biomédicales et précliniques
Blomme, Arnaud  
Hennequiere, Jean
MUTIJIMA NZARAMBA, Eugène ;  Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU > Service d'anatomie et cytologie pathologiques
Boniver, Jacques ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Département des sciences biomédicales et précliniques
Meuwis, Marie-Alice  ;  Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU > Service de gastroentérologie, hépatologie, onco. digestive
JOSSE, Claire  ;  Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU
KOOPMANSCH, Benjamin ;  Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU
SEGERS, Karin ;  Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU
Yokobori, Takehiko
Fahmy, Karim
Thiry, Marc  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences de la vie > GIGA-R : Biologie cellulaire
COIMBRA MARQUES, Carla ;  Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU > Chirurgie abdo, sénologique, endocrine et de transplantation
Garbacki, Nancy  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Laboratoire des tissus conjonctifs
Colige, Alain ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Laboratoire des tissus conjonctifs
Baiwir, Dominique  ;  Université de Liège - ULiège > GIGA-Technology platforms : Plate-forme protéomique
Bours, Vincent ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > GIGA-R : Génétique humaine
Louis, Edouard  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences cliniques > Hépato-gastroentérologie
Detry, Olivier  ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences cliniques > Département des sciences cliniques
Delvenne, Philippe ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Anatomie et cytologie pathologiques
Nishiyama, Masahiko
Castronovo, Vincenzo ;  Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Biologie générale et cellulaire
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Language :
English
Title :
Innovative methodology for the identification of soluble biomarkers in fresh tissues.
Publication date :
2018
Journal title :
Oncotarget
eISSN :
1949-2553
Publisher :
Impact Journals, United States - New York
Volume :
9
Issue :
12
Pages :
10665-10680
Peer reviewed :
Peer Reviewed verified by ORBi
Available on ORBi :
since 09 May 2018

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